技术背景

在原位水平解析细胞异质性及其分子图谱的空间组学已成为生命科学研究的关键前沿技术，而对细胞边界高效的标记与精准的细胞分割是实现单细胞分辨率空间图谱绘制与数据精准挖掘分析的关键环节。目前针对细胞分割主要基于细胞核染色与算法辅助实现，这类方法对细胞形态均一、排列规则的样品具有一定效果，而在面对细胞密度高、形态多样或细胞核与细胞质边界不清晰的复杂组织时，往往导致分割效果不佳容易造成大量细胞未被准确识别或边界误判。此外部分技术平台采用18sRNA和膜抗体等混合标记的方式，虽然可以进一步提高细胞分割准确性，但适用组织与细胞类型依然受限，满足不了日益增加的物种与组织类型需求。

因此，能够适用不同组织与细胞类型、边界标记精确、同时兼容RNA等靶标分子高效检测的细胞分割方案已成为提升空间组学技术空间分辨率与分析准确性的一个重要发展方向和目标。

解决方案

针对这一技术难题，鲲羽生物摒弃常规的“一刀切”策略，面对不同组织在细胞形态、密度、排列及胞核-胞质比例上存在高度异质性等问题，选择“量体裁衣式”的细胞分割方案。所谓“量体裁衣”是指针对特定物种、特定组织的特定细胞类型根据其细胞特性[谓之量体]使用特定的标记与染色方式来尽可能的勾勒出每一种类型的细胞边界[谓之裁衣]。为此，我们筛选了几十种不同类型的标记物，针对十几种常见样品类型进行了多次的测试与优化，最终开发了一套SMART（Specific-Multiplex-Architectural-Resolved-Tracing）-Cell Segmentation技术方案，实现兼容更多物种与组织类型的高精度细胞边界标记与分割，开启空间组真-单细胞分辨率新时代。

案例展示

以代表性常见样本为例，以实际组织切片采用SMART-Cell Segmentation方案和常规染核方案两种方式来展示实战效果差异。

（结果说明：第一张图为原始成像结果，第二张图为使用常规染核方案的细胞分割效果，第三张图为使用SMART-Cell Segmentation方案的细胞分割效果，分割工具为Cellpose4.0）

1、 脑组织和神经节等神经系统组织：由于神经元大小形状各异，常规细胞核染色难以识别神经元完整的形态轮廓，导致部分亚结构信息丢失。SMART-Cell Segmentation能够清晰勾勒出其各异的结构边界，为神经元分型与神经环路研究提供坚实的结构基础。

2、内脏器官组织：这类组织中细胞形态各异，如柱状上皮细胞、多核肝细胞、小核心肌细胞等，仅凭细胞核无法还原其真实的生物学形态。SMART-Cell Segmentation能有效克服核形态的干扰，精准呈现出各类细胞的完整边界，助力于器官发育、组织再生、功能代谢及疾病机制等领域的精准细胞生物学水平研究。

3、肿瘤组织：细胞类型与分布高度复杂，免疫细胞、基质细胞与肿瘤细胞紧密交错、间距极小，常规方式极易导致细胞分割错误，混淆关键基因的表达归属。SMART-Cell Segmentation可以真实还原肿瘤微环境中的细胞空间排布与互作模式，为探究肿瘤异质性、免疫逃逸及治疗应答等研究提供关键空间依据。

4、植物组织：由于植物细胞结构特殊性以及部分细胞液泡的存在，细胞核往往偏离中心且与细胞实际形态和大小差异显著，仅依赖核分割会导致细胞轮廓严重失真。SMART-Cell Segmentation可实现植物组织中每一个独立细胞单元的精准分割，为植物发育、逆境响应及基因空间表达研究奠定可靠基础。

鲲羽生物突破传统细胞分割的局限，通过对不同组织与细胞“量体裁衣式”的解决方案，实现细胞分割技术的全新升级，精准还原细胞的真实形态与空间关系，为单细胞空间多组学广泛而深入的应用提供了可靠的结构基础，推动空间组学告别模糊推测走向真正的单细胞洞察时代。

每一个细胞，都值得被清晰地看见！

更多样本类型持续更新中，我们致力于为每一种组织样本，提供清晰、精准的细胞地图。

技术升级，始于更多的需求；

终极呈现，源于更真的描绘。

立即体验SMART-cell segmentaion 从“通用推测”到“精准洞察”的变革。

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